更新时间:2024年11月24日
文章来源:广西凯发kaifa师范
凯发官网入口|大内亚里沙|诺奖AI成果开源!AlphaFold3代码人人可以免费
谷歌开源了诺贝尔奖模型AlphaFold3✿★◈,使生物医药和生命科学领域的科学家可以免费下载和使用模型代码✿★◈。
02AlphaFold3能够预测所有生命分子的相互作用✿★◈,包括蛋白质大内亚里沙✿★◈、DNA✿★◈、RNA以及一系列配体✿★◈、离子和化学修饰等✿★◈。
03与前两个版本仅预测蛋白质结构不同✿★◈,AlphaFold3的预测准确度提高了50%✿★◈,部分相互作用类别甚至提高了1倍✿★◈。
05此外✿★◈,DeepMind科学AI主管Pushmeet Kohli表示✿★◈,AlphaFold3的各种复现版本都已准备好凯发官网入口✿★◈,说明该模型即使没有开源也是可以复制的凯发官网入口凯发官网首页✿★◈。✿★◈。
至此来自生物医药大内亚里沙凯发网站✿★◈、生命科学等各个领域的科学家们都可以免费下载模型代码✿★◈,自行运行模型开展工作✿★◈。
与前两个版本仅可以预测蛋白质结构不同✿★◈, AlphaFold3能够预测所有生命分子的相互作用大内亚里沙✿★◈。这相当于打开了整个生命科学研究的新大门✿★◈,生命的基本过程被了解✿★◈,直接推动了药物发现和疾病治疗✿★◈。
以往这些工作往往需要数月的实验室工作和数百万资金才可以搞定✿★◈,还无法保证成功✿★◈。而现在科学家免费拥有了一把强大的利器✿★◈。
诺奖得主✿★◈、DeepMind AlphaFold 团队负责人John Jumper表示✿★◈,我们非常兴奋地看到人们用这个技术能做些什么✿★◈。
除了将预测范围扩大到了蛋白质✿★◈、DNA大内亚里沙✿★◈、RNA以及一系列配体✿★◈、离子和化学修饰等更多生物分子结构凯发K8天生赢家一触即发人文科学✿★◈!✿★◈,✿★◈,还创新性地用上了扩散模型✿★◈,可以生成每个原子的3D坐标✿★◈。
在不输入任何结构信息的情况下✿★◈,AlphaFold3预测准确度比现有方法提高了50%✿★◈,对于部分相互作用类别甚至提高了1倍✿★◈。
当时官方说的是✿★◈,全球科学家通过AlphaFold服务器即可免费访问使用AlphaFold 3进行非商业研究(开放大部分功能)✿★◈。
换句话说✿★◈,没有像AlphaFold2那样开放底层代码✿★◈,而是通过网络服务器提供访问权限k8凯发国际✿★◈。✿★◈。官方还推出了免费的工具AlphaFold Server✿★◈,科学家只需点击几下就模拟由蛋白质✿★◈、DNA✿★◈、RNA 以及一系列配体✿★◈、离子和化学修饰组成的结构凯发官网入口k8凯发国际首页✿★◈,✿★◈。
虽说免费✿★◈,但实则限制不少✿★◈,每天只能进行10次预测凯发官网入口✿★◈,而且不可能获得可能与药物结合的蛋白质结构✿★◈。
不免让人怀疑之所以不开源✿★◈,是因为谷歌Deepmind自己用来进行药物开发✿★◈。当时他们成立的公司Isomorphic Labs使用AlphaFold3通过自己的管道或与其他制药公司合作开发药物诺贝尔奖✿★◈。✿★◈。
如今半年过去✿★◈,应该算是说到做到✿★◈。不过模型权重需要单独申请✿★◈,填写表单✿★◈,同不同意由DeepMind决定大内亚里沙✿★◈。
成对残基关系编码器(Pairformer)取代了原有的进化特征处理单元(Evoformer)✿★◈,增强了复杂相互作用模式的建模能力
为了避免扩散方法在一些无结构区域产生幻觉大内亚里沙✿★◈,还引入了一种新的交叉蒸馏方法✿★◈,通过AlphaFold-Multimer v2预测的结构数据来丰富训练数据✿★◈。
更让人惊叹的是✿★◈,AlphaFold 3即便在训练数据极度匮乏的领域k8凯发天生赢家一触即发✿★◈,✿★◈,也展现出了惊人的泛化能力凯发官网入口✿★◈。举个例子✿★◈,在CASP15的RNA预测任务中✿★◈,它在10个公开靶点上的平均表现超过了专门的RNA结构预测模型✿★◈。要知道大内亚里沙✿★◈,这可是在几乎没有RNA训练数据的情况下实现的✿★◈。
值得一提的是✿★◈,DeepMind 科学AI主管Pushmeet Kohli还说了一嘴✿★◈,AlphaFold3各种复现版本都有了✿★◈。这说明该模型即使没有开源也是可以复制的✿★◈。
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